有的，但是不多见。 边牧的基因库中，控制眼睛颜色的基因有两个，分别是C and E。这两个基因在决定毛颜色的时候起到了很大作用。其中 C 大约能引起 15 种不同的眼睛颜色，而 E 大约能引发 60 种不同眼睛颜色。也就是说，当两个边牧一个是蓝色眼睛，另一个是棕色眼睛的话，它们至少有三种颜色的遗传可能（两种眼睛颜色，一种毛发颜色）。而如果其中一个边牧是纯红色的，那么另一个就可能是蓝色、橙色或棕色眼，因为红毛的颜色是由一个基因决定的。所以红、黑、白三色的搭配是有一定规律性的。
不过，虽然多数的黑色边境牧羊犬都是褐色眼睛，但黑眼睛的边牧也是有的。同理，虽然不是所有浅色的边境牧羊犬的眼睛都是蓝色的，但大多数确实是这样的。 至于题主说的“一只纯黑色的边境，却有异奇的蓝色眼睛”，这种情况是有可能的，只不过非常少见。对于边牧的眼睛来说，“异奇”的确切描述应该就是“淡蓝色”。
戴鸿远优质答主边境牧羊犬只有棕色，棕红色，黑色，黑红配色；而边牧的双眼呢，多为深棕色，少部分为双色眼和蓝眼，蓝眼的机率较低。一般来讲， 深棕色眼睛的犬的瞳孔颜色为棕色；双色眼犬的瞳孔为上下两个瞳孔， 都为棕色；蓝眼犬的瞳孔为深棕色，蓝眼睛边境牧羊犬比较少见。 而且，如果在购买的时候，你从哪里买了一只蓝眼睛的边境牧羊犬，如果一个月后，它变成了棕眼睛的话，那么这只狗天生就是一只棕眼睛，它属于褪蓝现象，属于正常现象．
幼年的边境牧羊犬在出生两个月后开始褪蓝，一般到3个月左右眼睛就会成为终身的颜色。有的褪蓝时间晚一些，最长有到5个月的。如果5个月眼睛还没褪完，那就可能是这只狗就是蓝眼狗了，所以说犬眼的颜色变化时间是不好确定的。
而且如果犬眼在出生7天到15天内就开始褪蓝的，那么当眼睛颜色确定之后，瞳孔就可能出现异于眼球的颜色，这种情况是褪蓝过早，瞳孔着色不足造成的，并不是犬生病或者先天不足。
还有一部分犬，眼球和瞳孔都是深棕色，但眼白部分却有部分或者大部分为蓝色，这些犬也俗称蓝眼犬，但与真正的蓝眼犬有区别。
（注：“褪蓝”是指犬出生时眼睛为蓝紫色，随着日龄的增长，眼睛的颜色逐渐变为深棕色或者其他颜色的犬眼变化过程。）
